Em 2005, foi aprovado pela Financiadora de Estudos e Projetos-FINEP o projeto “Implantação de infraestrutura de apoio a pesquisa e à Pós-Graduação em Agricultura Tropical” que permitiu a construção de um prédio que abriga laboratórios (Geoprocessamento, Microbiologia do Solo, Forragicultura, Fitotecnia, Ecofisiologia Vegetal, Biotecnologia e Recursos Genéticos), auditório e salas de apoio para secretaria, informática, docentes e discentes da Pós-Graduação.

Além desses espaços, a Pós-Graduação em Agricultura Tropical utiliza os seguintes laboratórios de pesquisa e ensino da Faculdade de Agronomia e Zootecnia: 

1. Laboratório de Análise de Sementes

2. Laboratório de Fitopatologia

3. Laboratório de Entomologia

4. Laboratório de Microbiologia do solo

5. Laboratório do Núcleo de Tecnologia em Armazenamento

6. Laboratório de Fertilidade e Química do Solo

7. Laboratório de Nutrição Mineral de Plantas

8. Laboratório de Biotecnologia

9. Laboratório de Tecnologia de Alimentos e de Nutrição

10. Laboratório de Física do Solo

11. Laboratório de Ecofisiologia

12. Laboratório de Recursos Genéticos

13. Laboratório de Agricultura de Precisão

14. Estação Meteorológica na Fazenda Experimental da FAMEVZ/UFMT

15. Laboratório de Geoprocessamento

16. Laboratório Multiusuário para Estudos Pedohidrológicos de longa duração no Pantanal Mato-grossense